口腔医学系现设有4个实验室，分别为口腔虚拟仿真实验室、口腔手术显微镜实验室、口腔解剖生理学实验室及口腔综合实验室，配备了数字化虚拟仿真培训系统、仿真患者头颅模型治疗操作系统、口腔临床模拟实习系统、肌电仪、下颌运动轨迹扫描仪、口腔教学数字观察仪、口腔显微镜等先进设备，在国内高校中处于领先水平，有助于学生在临床实习前完成系统性的模拟培训，获得具有国际视野的教学体验。

口腔临床实习基地主要为以汕头大学医学院口腔医院为中心纽带、联结汕头大学医学院第二附属医院、汕头大学医学院附属肿瘤医院以及汕头市康诺德医疗科技有限公司形成的教学基地网络，具有粤东地区首屈一指的临床实习教学资源，为口腔医学系学生提供充足的临床教学、见习、实习的机会。